IC卡卡内操作系统是智能卡芯片内的一个监控软件，它在智能卡行业内地位就相当于DOS在计算机中的地位。IC卡卡内操作系统是管理用户信息数据和文件的系统，系统运行时接收来自IC卡读写器的命令，进而解释并执行命令。
IC卡卡内操作系统由四个智能卡模块组成：通讯管理模块；安全管理模块；应用管理模块；文件管理模块。
1.通讯管理模块
该模块接受IC卡读写器命令；并对命令的正确性进行判断，若命令正确，指令发送到安全管理模块进行下一步执行；若命令错误，发出请求重发指令的信号。
2.安全管理模块
安全管理模块是IC卡应用系统的重要部分，是智能卡行业能够快速发展的原因。安全管理模块是验证所有命令和指令的安全性的处理器模块，负责整个系统数据的安全保障。
3.应用管理模块
应用管理模块是对接收的命令进行可执行性判断，主要表现为对文件访问权限的安全控制，常常融于安全管理和文件管理之中。
4.文件管理模块
IC卡内部数据都是以文件形式存储在IC卡内，所以文件管理模块的作用是管理IC卡内部文件数据，对内部文件数据读写和更改时都是经过文件管理模块。
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