IC卡软件包括三部分：内部程序、内部应用程序和外部应用程序。
内部程序由IC卡制造商提供，它以封闭式微处理器机器语言写入到只读存储器中，而且不能以任何方式加以更改。
内部应用程序是指根据IC卡的持卡人的需要输入到EPROM或EEPROM中的程序，这就需要真正的和完整的操作系统。
随着IC卡日益成为信息系统的重要组成部分，它就必须承担越来越复杂的工作，并以一种更灵活的方式与其他部件一起分担分布式任务。更准确些说，它可能从目前的被动设备发展成主动设备，需要功能更强的外部应用程序把IC卡部件完全结合到信息处理系统中去。这种外部应用程序包括在IC卡读写器、PC机或通过网络访问的主计算机中，一般包括以下几种：智能IC卡应用分析软件、通用通信软件、极端分布或数据库模型、高级数据管理语言、模拟和证实软件。
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