IC卡读写器的PC端的高级语言程序，主要包括发卡、通讯、控制、用户管理等模块。用户管理模块有包含IC卡管理、交易统计、报表生成和打印功能。IC卡读写器的内部程序是在相应单片机仿真开发系统上编制调试而成，将仿真开发系统通过的程序装入读写器，一般都不会有问题。
专用的IC卡读写器的程序在出厂时已经设计完毕，用户可直接调用，不存在二次开发问题；但是通用IC卡读写器的用户可借助读写器厂家的二次开发平台进一步开发，这些平台包含各种可供用户调用的读写器基本操作程序模块及接口规范，供用户编写与具体应用对应的应用程序时直接调用。
但是这其中存在两个问题：
1.二次开发平台仅仅涉及读写器的各种最基本操作，主程序及其他相关程序仍需要用户自己编写。
2.由于不同厂家的IC卡读写器可能遵循不同的传输协议等因素，上述接口函数的形式也可能不同，用户必须仔细参阅对应厂家提供的读写器开发使用说明书。
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